Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/10316/97665
Title: A utilidade de um painel sindrómico de biologia molecular no diagnóstico de infeções do Sistema Nervoso Central de etiologia vírica
Other Titles: The usefulness of syndromic testing by molecular biology in the diagnosis of infections of the Central Nervous System of viral aetiology
Authors: Costa, Márcia Daniela Moreira da
Orientador: Brett, Ana Cristina de Oliveira
Rodrigues, Fernanda Maria Pereira
Keywords: Meningite; Encefalite; Vírus; Biologia Molecular; Meningitis; Encephalitis; Virus; Molecular Biology
Issue Date: 25-Jun-2020
Serial title, monograph or event: A utilidade de um painel sindrómico de biologia molecular no diagnóstico de infeções do Sistema Nervoso Central de etiologia vírica
Place of publication or event: Faculdade de Medicina da Universidade de Coimbra
Abstract: Introduction: Virus are the main aetiology of Central Nervous System (CNS) infections, with the paediatric population at higher risk. The aim of this study was to characterise CNS infections of viral aetiology diagnosed by molecular biology syndromic testing and to assess the impact of its implementation in a paediatric hospital during 3.5 years.Material and Methods: A cross-sectional analytic study was conducted with retrospective data collection of all the clinical cases with CNS infection of viral aetiology diagnosed by polymerase chain reaction (PCR) syndromic testing in Hospital Pediátrico of Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra from January/2016 to June/2019. Until January/2018, the test was available during working days and since then is used 24 hours a day, every day of the week. Demographic factors, clinical features, diagnostic tests, treatment and outcome were evaluated. Statistical analysis was done using SPSS25®.Results: Fifty-three cases were included: 79.2% enterovirus (EV), 11.3% human parechovirus (HPeV), 3.8% human herpes virus 6 (HHV-6), 3.8% varicella zoster virus (VZV) e 1.9% herpes simplex virus 2 (HSV-2). In one case of EV, HHV-6 was simultaneously detected. From the total number of cases, 58.5% were male, with a median age of 9.7 months (IQR 85.8). Fever was the most common symptom (79.2%). In group A (age <12 months, n=27) all presented with a normotensive anterior fontanelle. In group B (children and adolescents, n=26), 92.3% had headaches, 34.6% photophobia and/or phonophobia and 92.3% neck stiffness. Of the 53 cases, 71.7% had pleocytosis (median 40 cells/mm3, IQR 151; three cases with >1000 cells/mm3), with predominance of mononuclear cells in 57.9%. Cerebrospinal fluid protein count was elevated in 45.3% and glucose count low in 9.4%. Empirical treatment was started in 79.2% before 2018, and in 37.9% after 2018, with statistical significance (p=0,005). Of the 29 cases (54.7%) that started antibiotics, 41.4% stopped after identification of a virus. Of the 26.4% (n=14) who started acyclovir, three maintained it as treatment (VZV and HSV-2). Median duration of admission was two days (IQR 3). There was one false positive for HSV-2. Discussion: Identification of the virus through PCR syndromic testing allowed for the optimisation of treatment. From 2018, the therapeutic approach of non-urgent cases became more expectant, confirmed by a statistically significant reduction in initiating empirical treatment.Conclusions: PCR syndromic testing is a sensitive and easy-to-execute test that allows for the rapid aetiologic diagnosis of microorganisms usually associated with CNS infections, with subsequent improvement of both clinical and therapeutic approaches.
Introdução: Os vírus constituem a principal etiologia das infeções do Sistema Nervoso Central (SNC), sendo a população pediátrica de elevado risco. O objetivo deste estudo foi caracterizar as infeções do SNC de etiologia vírica diagnosticadas através de um painel sindrómico de biologia molecular e avaliar o impacto da sua implementação num hospital pediátrico durante 3,5 anos.Materiais e Métodos: Estudo observacional, transversal e analítico, com colheita retrospetiva de dados dos casos de infeção do SNC de etiologia vírica diagnosticados através de um teste sindrómico de polymerase chain reaction (PCR) no Hospital Pediátrico do Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra, de janeiro/2016 a junho/2019. Até janeiro/2018 o teste esteve disponível em horário normal durante dias úteis e desde então é realizado 24 horas/dia, todos os dias. Foram avaliados dados demográficos, manifestações clínicas, exames complementares, tratamento e evolução. A análise estatística foi realizada em SPSS25®.Resultados: Foram diagnosticados 53 casos: 79,2% enterovírus (EV), 11,3% parechovírus humano (HPeV), 3,8% vírus herpes humano 6 (HHV-6), 3,8% vírus varicela zoster (VZV) e 1,9% vírus herpes simplex 2 (HSV-2). Num caso de EV detetou-se simultaneamente HHV-6. Do total, 58,5% eram do sexo masculino, com idade mediana de 9,7 meses (IQR 85,8). A febre foi a manifestação mais comum (79,2%). No grupo A (idade <12 meses, n=27) todos apresentaram fontanela anterior normotensa. No grupo B (crianças e adolescentes, n=26), 92,3% apresentaram cefaleias, 34,6% fotofobia e/ou fonofobia e 92,3% rigidez da nuca. Dos 53, 71,7% tinham pleocitose (mediana 40 células/mm3, IQR 151; três com >1000 células/mm3), 57,9% com predomínio de mononucleares. A proteinorráquia estava elevada em 45,3% e a glicorráquia diminuída em 9,4%. Iniciaram tratamento empírico 79,2% antes de 2018 e 37,9% após, com significado estatístico (p=0,005). Dos 29 (54,7%) que iniciaram antibioticoterapia, em 41,4% foi suspensa após identificação de vírus. Dos 26,4% (n=14) que iniciaram aciclovir, três mantiveram como tratamento (VZV e HSV-2). A duração mediana de internamento foi dois dias (IQR 3). Houve um falso positivo para HSV-2.Discussão: A identificação do vírus através do teste sindrómico de PCR permitiu otimizar a terapêutica instituída. Verificou-se que, a partir de 2018, a abordagem terapêutica dos casos não urgentes se tornou mais expectante, demonstrado pela diminuição estatisticamente significativa em iniciar tratamento empírico.Conclusão: O teste sindrómico de PCR é um teste sensível e de fácil execução, que permite a diagnóstico etiológico rápido de microrganismos usualmente associados a infeções do SNC, com consequente melhoria na abordagem clínica e terapêutica.
Description: Trabalho Final do Mestrado Integrado em Medicina apresentado à Faculdade de Medicina
URI: https://hdl.handle.net/10316/97665
Rights: embargoedAccess
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