Relatório de Estágio

Abstract

No âmbito do Estágio Curricular, decorrido ao abrigo do Mestrado de Análises Clínicas da Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra, realizei um estágio no serviço de Patologia Clínica do Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra (CHUC). Este estágio teve como principais objetivos a aquisição de experiencia prática e a aquisição de competências científicas e técnicas relativas às 4 valências principais: Bioquímica Clínica, Hematologia, Imunologia e Microbiologia. Em sequência deste estágio escrevi o presente relatório com o objetivo de, em primeiro lugar, consolidar os conhecimentos obtidos durante todo o mestrado, mas principalmente durante o estágio e, em segundo lugar, dar a conhecer quais as atividades desenvolvidas. Apesar de durante todo o tempo de estágio ter integrado de forma ativa na rotina laboratorial e ter participado na interpretação e validação de resultados relativas a todas as valências, o presente relatório apenas aborda de forma mais profunda os temas das áreas de Microbiologia e da Imunologia. Estruturalmente o Relatório contém a descrição do local de estágio e a descrição das atividades desenvolvidas, com especial enfase nas secções laboratoriais de Microbiologia e Imunologia. Especificamente, a abordagem á secção laboratorial de Microbiologia inicia-se pela descrição de todos os espaços que constituem a secção e a descrição das fases do diagnóstico Microbiológico, salientando a importância da colheita e do transporte adequado da amostra na fase pré-analítica. No CHUC a secção laboratorial de Microbiologia é constituída por 4 laboratórios: Laboratório de Bacteriologia, Laboratório de Micobactérias, Laboratório de Parasitologia e Laboratório de Micologia. No relatório são abordados apenas os três primeiros laboratórios e existe também uma breve abordagem ao laboratório de Virologia, uma vez que tive a oportunidade de observar a rotina do laboratório de Virologia situado no Hospital Pediátrico.A descrição pormenorizada do laboratório de bacteriologia inicia-se pela descrição dos objetivos do laboratório no diagnóstico de doenças bacterianas infeciosas: o crescimento, o isolamento, a identificação e a determinação da suscetibilidade antimicrobiana in vitro do ou dos microrganismos presentes na amostra que são os possíveis causadores de doença. Em prol destes objetivos existe a descrição dos métodos utilizados no diagnostico laboratorial : 1)Microscopia da Amostra, com as respetivas técnicas utilizadas; 2)Cultura in vitro, com a descrição dos tipos de meios utilizados, composição e propósito, a descrição das técnicas de sementeira utilizadas e a observação das características culturais dos microrganismos em cultura; 3) Métodos de identificação e respetivos equipamentos utilizados; 4) Testes de suscetibilidade automatizados e manuais e respetivos equipamentos utilizados. Ainda em Bacteriologia existe a descrição das principais amostras recebidas, da forma como são processadas e quais os principais agentes etiológicos que podem estar presentes e ser causadores de doença. Segue-se o Laboratório de Micobactérias, com a descrição das principais Micobactérias causadoras de infeção em humanos e da forma como o diagnóstico laboratorial é realizado: 1)Descontaminação e Concentração das amostras; 2)Microscopia da amostra, com a descrição das técnicas utilizadas; 3)Cultura in vitro, com a descrição dos meios de cultura utilizados e dos tempos de incubação; 4)Métodos de Identificação, com a descrição dos testes moleculares de identificação mais utilizados. Já o laboratório de Parasitologia está divido no diagnóstico laboratorial efetuado em amostras de fezes e parasitas intestinais e amostras de sangue e hemoparasitoses. Para cada tipo está sucintamente descrito a forma como se faz a colheita , os principais parasitas presentes e as técnicas utilizadas para a sua pesquisa. Relativamente á secção laboratorial de Imunologia CHUC, está contida a descrição de todos os espaços que constituem a secção. A secção engloba os laboratórios de Imunologia, da autoimunidade e da serologia infeciosa. O presente relatório aborda os laboratórios de Imunologia e da Autoimunidade. No laboratório de imunologia há a descrição dos parâmetros imunoquímicos determinados e dos respetivos equipamentos, a descrição dos proteinogramas, imunofixação sérica e urinária. Em destaque para os proteinogramas e para imunofixação sérica e urinária existe a descrição do principio do método e da forma como é interpretado. Esta secção contem ainda generalidades sobre as patologias que podem ser diagnosticadas por estes métodos com especial destaque para o diagnóstico de gamapatias. Por fim o laboratório de autoimunidade que contempla, uma breve introdução ás doenças autoimunes, Técnicas de Imunofluorescência Indireta, Ensaios Imunoenzimáticos, Quimiluminescência, Radioimunoensaios . Para cada um dos métodos anteriores esta descrito o principio do teste e a aplicação no laboratório para o diagnóstico de doenças autoimunes.

In the scope of the Curricular Internship, held under the Master of Clinical Analysis of the Faculty of Pharmacy of the University of Coimbra, I completed an internship in the Clinical Pathology department of the Hospital and University Center of Coimbra (CHUC). The main objective of this internship was the acquisition of practical experience and the acquisition of scientific and technical competences related to the four main areas: Clinical Biochemistry, Hematology, Immunology and Microbiology. Following this stage I wrote the present report with the aim of first consolidating the knowledge obtained during the entire masters, but mainly during the internship and secondly to make known the activities developed. Although during the entire internship period, it has actively integrated into the laboratory routine and participated in the interpretation and validation of results related to all aspects, this report only addresses in a deeper way the themes of the areas of Microbiology and Immunology.Structurally the Report contains the description of the internship location and the description of the activities developed, with special emphasis on the laboratory sections of Microbiology and Immunology. Specifically, the approach to the laboratory section of Microbiology begins by describing all the spaces that make up the section and the description of the phases of the Microbiological diagnosis, emphasizing the importance of harvesting and adequate transport of the sample in the pre-analytical phase.In CHUC the laboratory section of Microbiology consists of 4 laboratories: Laboratory of Bacteriology, Laboratory of Mycobacteria, Laboratory of Parasitology and Laboratory of Mycology. In the report only the first three laboratories are addressed and there is also a brief approach to the Virology laboratory, since I had the opportunity to observe the routine of the laboratory of Virology located in the Pediatric Hospital.The detailed description of the bacteriology laboratory begins with a description of the laboratory's objectives in the diagnosis of infectious bacterial diseases: growth, isolation, identification and determination of the in vitro antimicrobial susceptibility of the micro-organism (s) present in the sample of disease. In support of these objectives there is a description of the methods used in the laboratory diagnosis: 1) Sample Microscopy, with the respective techniques used; (2) In vitro culture, describing the types of media used, composition and purpose, description of the sowing techniques used and observation of the cultural characteristics of micro-organisms in culture; 3) Identification methods and equipment used; 4) Automated and manual susceptibility tests and respective equipment used. Still in Bacteriology there is a description of the main samples received, how they are processed and what are the main etiological agents that may be present and cause disease. The Mycobacteria Laboratory, with the description of the main Mycobacteria causing infection in humans and the way in which the laboratory diagnosis is carried out, follows: 1) Decontamination and Concentration of the samples; 2) Microscopy of the sample, with a description of the techniques used; 3) In vitro culture, with description of the culture media used and the incubation times; 4) Identification methods, with a description of the most commonly used molecular identification tests. The laboratory of Parasitology is divided in the laboratory diagnosis made in samples of feces and intestinal parasites and blood samples and hemoparasitoses. For each type is described briefly the way in which the crop is harvested, the main parasites present and the techniques used for its research.Regarding the laboratory section of CHUC Immunology, the description of all the spaces constituting the section is contained. The section encompasses the laboratories of Immunology, autoimmunity and infectious serology. This report addresses the laboratories of Immunology and Autoimmunity. In the immunology laboratory there is a description of the determined immunochemical parameters and their equipment, the description of the proteinograms, serum and urinary immunofixation. A description of the principle of the method and the way in which it is interpreted is given in the case of proteinograms and for serum and urinary immunofixation. This section also contains general information about the pathologies that can be diagnosed by these methods, with particular emphasis on the diagnosis of gammatids. Finally the autoimmunity laboratory that contemplates, a brief introduction to autoimmune diseases, Indirect Immunofluorescence Techniques, Immunoenzymatic Assays, Chemiluminescence, Radioimmunoassays. For each of the above methods the principle of the test and the application in the laboratory for the diagnosis of autoimmune diseases are described.